RRBS

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RRBS 經濟準確高效的甲基化研究

簡化甲基化測序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS)通過酶切富集啟動子及 CpG 島區域,并進行 Bisulfite 測序,同時實現 DNA 甲基化狀態檢測的高分辨率和測序數據的高利用率。作為一種高性價比的甲基化研究方法,簡化甲基化測序在大規模臨床樣本的研究中具有廣泛的應用前景。

精確度高、重復性好、檢測范圍廣、性價比高

單堿基分辨率;適用于多樣本間的差異分析,多樣本間覆蓋重復度高于85%;
可覆蓋全基因組范圍內超過5百萬個 CpG 位點;測序區域更具針對性,數據利用率更高。
具有“精確度高、重復性好、檢測范圍廣、性價比高”的優勢,已廣泛應用于人、小鼠、豬等高等哺乳動物。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

諾禾致源的 RRBS 是基于啟動
子及 CpG 島區域,實現單堿
基分辨率的甲基化位點精準定
位,快速準確地找到差異位
點,實現高效分析 DMR 及相
關基因的功能分析。

MeRIP-seq 分析內容 解決問題
標準分析 測序數據質量評估 過濾掉低質量數據,保證數據質量
參考序列比對分析 比對率和覆蓋度分析
甲基化位點 calling 分析甲基化位點
甲基化分布 甲基化在基因組及功能
元件上的分布
差異甲基化分析 尋找 DMR
尋找 DMR 相關基因 GO,KEGG 富集分析
個性化分析、多組學關聯分析需聯系產品經理進行評估。

悅讀高質量測序數據,盡享 HPC 澎湃動力

簡化甲基化測序采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

諾禾致源已經成功完成對人、大小鼠、牛、豬等物種超過400例的簡化甲基化測序分析,助力客戶科學研究及發表文章。“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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