BSA性狀定位

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快速定位極端性狀基因

BSA性狀定位針對目標性狀,選擇表型極端差異的親本構建家系,對該家系
目標性狀表型極端的子代分別混合得到的兩個樣本池進行全基因組重測序,
檢測到的兩池間DNA差異片段即為候選區域,可進一步定位到目標性狀相關的基因或標記。

周期短 定位準 性價比高

基于全基因組重測序的BSA性狀定位,可快速準確地找到差異位點,
實現目標性狀基因的高效定位,具有“周期短、定位準、性價比高”的優勢,
已廣泛應用于水稻、擬南芥、番茄等物種。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

基于比對分析發現SNP、InDel標記,隨后根據標記進行差異分析,
以獲取與目標性狀相關的基因。

分析內容 解決問題
與參考基因組比對 比對率和覆蓋度分析
SNP、InDel檢測及注釋 開發SNP、InDel標記
子代SNP、InDel頻率差異分析 尋找有差異的SNP、InDel位點
目標性狀區域定位 找到與目標性狀關聯的區域
候選基因提取和功能注釋 獲得候選基因及基因功能

全基因組范圍挖掘性狀相關位點

基于全基因組重測序技術,諾禾致源的BSA性狀定位,是對整個基因組
進行測序分析,以獲得全基因組范圍的所有變異信息, 力爭不錯過任何一個與性狀相關的位點。

為何不能選擇簡化基因組BSA?

由于簡化基因組測序捕獲到的基因組區域有限,若變異區域未被捕獲,則與目標性狀相關的基因
將不能獲取,因此全基因組重測序在BSA性狀定位方面具有明顯的優勢。

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

BSA性狀定位采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

至2019年8月,諾禾致源已對糧食作物類、經濟作物類、果蔬類、水產等幾十個物種進行精確目標性狀定位。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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