Hi-C測序

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前沿技術帶你走進DNA的三維空間

Hi-C技術是染色體構象捕獲(Chromosome conformation capture,簡稱為3C)
的一種衍生技術,是指基于高通量進行染色體構象的捕獲,
它能夠在全基因組范圍內捕捉不同基因座位之間的空間交互信息,
研究三維空間中調控基因的DNA元件。

高通量染色體構象捕獲技術

Hi-C技術是高通量染色體構象捕獲技術
(High-throughput chromosome conformation capture)。
利用高通量測序技術,結合生物信息學分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA
在空間位置上的關系,構建染色體跨度單體型,同時捕獲不同基因座位上之間的空間交互信息,
獲得高分辨率的染色質三維結構信息,并能開發調控基因的DNA元件。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

分析內容=標準分析+高級分析。
構建染色體跨度單體型,基于全基因組的互作信息,獲得高分辨率
的染色質三維結構信息,并能開發調控基因的DNA元件。
此外,還可結合轉錄組,重測序和ChIP-seq數據進行聯合分析,從堿基變化、
基因表達、蛋白修飾及染色體三維構象分析等多方面深入探討生物學問題。

構建染色體跨度單體型 三維結構重構以及調控元件開發
測序質量評估
Hi-C數據質控比對統計
插入片段統計
NT庫比對
比對參考基因組 比對及過濾
SNP檢測與注釋 互作圖譜構建
InDel檢測與注釋 TAD分析
基因組雜合度統計 三維結構重構
染色體跨度單體型構建 調控元件的開發

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

Hi-C技術采用先進的HiSeq PE150平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

至2017年12月,已經成功實現人、小鼠、大鼠、禽類、哺乳動物、魚類、貝類、微生物類
(真菌和原核生物)、擬南芥、水稻、玉米、大豆、棉花、小麥、油菜、花生、果樹、林木、蔬菜等多種動植物的Hi-C測序和分析。
多樣化的樣本類型均可成功進行Hi-C文庫構建,同時先進完善的實驗流程和測序平臺,保證優質的有效數據。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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