單細胞基因組測序

產品介紹常見問題經典案例


單細胞基因組測序

產品介紹常見問題經典案例


先進的技術,大有用武之地

單細胞測序通過對單個細胞進行基因組擴增和測序,
解決了用組織樣本無法獲得不同單個細胞的異質性信息、樣本量太少無法進行常規測序的難題,
為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向,
為早期檢測、診斷疾病及疾病的個體化治療提供指導。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

單細胞測序可針對性揭示單個細胞整體水平的基因信息,解決了細胞異質性難題。
可最真實的獲得單克隆細胞的具體突變來源及精準的突變頻率,
用來研究疾病以及癌癥發生發展機制等。

Single cell 全基因組/外顯子組測序
癌癥基因組學 疾病基因組學
標準信息分析A 標準信息分析A+ 標準信息分析Pro

去除接頭污染序列及低質量數
據比對,產出數據統計SNP檢
測、注釋和統計InDel檢測、注
釋和統計CNV檢測、注釋和統
計(僅全基因組測序)SV檢
測、注釋和統計(僅全基因組
測序)

1. 數據質控:去除接頭污染和
低質量數據
2. 與參考序列進行比對、統計
測序深度及覆蓋度
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV檢測、注釋及統計(腫瘤成
對樣本)

1. 數據質控:去除接頭污染和低質量
數據
2. 與參考序列進行比對、統計測序深
度及覆蓋度
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV檢
測、注釋及統計(腫瘤成對樣本)
4. 單細胞Germline SNP聚類分析
5. PAC(主成分)分析
6. Heatmap展示圖(somatic
SNV)
7. 高頻突變分析(>2對樣本)
  7.1高頻突變基因統計
  7.2高頻突變基因富集分析
8. NMF突變特征/突變頻譜分析
  8.1突變頻譜分析
  8.2NMF突變特征分析(>2對樣
本)
9. NovoDriver已知驅動基因篩選
10. 基因組變異Circos圖展示

1. 樣本間協同性分析(腫瘤單細胞樣
本數量≥2,且必須有組織樣本)
2. MRT高頻突變基因相關性分析(>
2對樣本)
  2.1高頻突變基因協同作用分析
  2.2高頻突變基因互斥作用分析
3. OncodriveCLUST驅動基因預測
(>2對樣本)
4. 突變位點分布情況分析
  4.1高頻突變基因SNV/InDel突變
位點展示
  4.2預測驅動基因SNV/InDel突變
位點展示
5. 高頻CNV分析
  5.1 CNV分布分析
  5.2 CNV重現性分析(>2對樣
本)
6. 雜合性缺失(LOH)分析
7. LOF蛋白功能缺失分析
8. NovoDrug高頻突變基因靶向用藥
預測
9. NovoDR耐藥突變篩選
10. NovoNoncoding非編碼區高頻
突變分析(單細胞外顯子測序僅不包
括此分析)

* 定制化信息分析,可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

基因組測序采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節,助力科學研究

采用國際認可的全基因組擴增技術

多次退火環狀循環擴增技術
(Multiple annealing and looping-based amplification cycles, MALBAC),具有低偏倚性。

定制化信息分析

針對不同項目,除了進行標準信息分析外,通過與合作伙伴共同探討,制定可行的個性化信息分析方案,整合各種主流軟件,優化分析結果,以確保結果的準確性及創新性。

豐富的項目經驗

諾禾致源已成功完成單精子全基因組測序、單細胞轉錄組測序等,相關研究成果在Science、 Nature等頂級科學期刊發表。

金7乐技巧